Что было изначально, меня не интересует. Важно, что есть сейчас. Без исходников H3 VCMI никогда не докажут, что они идентичны H3. Потом, лично мне модить под VCMI, да и вообще под кого-то, чтобы зависеть от того, какие возможности мне предоставят, неинтересно. А сливаться с ними - так у нас различные взгляды на мир, если можно так сказать. И мы делаем вещи по-разному. В частности, Хота - это мод для Сод, это принципиально, что только от нашего желания зависит, что будет в результате разработки (совместимость с Эрой нужна, но эталон - всё равно под Сод). А VCMI - это воссоздание Вога.
А насчёт "потеряет смысл" - это всё праздные разговоры. Пока что не видно, чтобы что-то было популярнее чистых H3, так что есть ли вообще смысл как в нашей работе, так и в их, - это ещё вопрос.